儿童夜惊症患者应该根据病因选择需要就诊的科室。
1、如果是由于患儿饮食不节造成的积食，或者胃肠道功能异常而导致的儿童夜惊症，可以就诊于小儿消化内科。
2、如果是由于患儿感染、发热导致的儿童夜惊症，可以就诊于小儿内科。
3、如果是由于癫痫、大脑发育迟滞等原因引起的儿童夜惊症，可以就诊于神经内科。
4、如果是由于人际交往困难，父母教育方式错误，或者父母无法与孩子正常沟通等精神心理因素导致的儿童夜惊症，需要就诊于精神心理科。
对于儿童夜惊症患者，需要进行血常规、尿常规、血生化等检查，还需要进行心电图、头颅核磁等检查，明确患儿大脑发育的情况，还需要进行心理测试，明确患儿的智力发育水平、人际交往能力、社会交往能力、精细运动和大运动（全身大肌肉活动，包括身体协调性、平衡性和灵活性，以及头颈部、躯干和四肢自主控制）的情况、记忆力、反应能力、逻辑思维能力等，以明确儿童夜惊症的原因，针对原因进行相应的治疗。