治疗毛囊炎的药物选择，通常需要医生根据病因来分析。
1、感染性因素所致的毛囊炎
如果毛囊炎是由金（黄色）葡萄球菌等感染引起，常首选阿莫西林等抗生素进行治疗。
2、非感染性因素所致的毛囊炎
如果本病由于青春期皮脂分泌旺盛引起，则要根据患者的具体情况，进行具体分析。
（1）若因饮食不节、暴饮暴食等导致胃肠湿热引起的毛囊炎，则需清除胃肠湿热，节制饮食，才能取得比较好的效果。
（2）若由于内分泌失调造成月经不规律等问题（一般在月经前较为明显）引起的毛囊炎，则通常需要调整冲任，使用一些调经的药进行对症治疗，才能取得比较好的效果。
