肠穿孔手术时间主要取决于手术的难易程度和疾病的严重程度。

1、如果是十二指肠溃疡穿孔，可以进行腹腔镜手术，将穿孔部位缝合修补，再用大网膜进行覆盖，然后充分清洗腹腔，最后进行引流。一般来说，1～2个小时就可以完成手术。

2、如果肠穿孔时间比较长，已经造成腹腔严重感染和粘连，手术时间就比较长，可能需要5～6个小时，甚至更长。在手术过程中，要彻底清理炎性分泌物，进行肠道重建。部分患者还需要切除肠段，但如果形成炎性包块，就比较难分离、切除。肠道重建后，还需要进行局部清洗和全腹腔清洗，并进行引流。如果肠道切除后，两端不能吻合，就需要进行造瘘手术。在手术过程中，可能会发生出血、副损伤（其他脏器损伤）等，就需要及时止血，并进行相应的处理。