要根据肠穿孔的部位，选择合适的手术方式。

1、如果是十二指肠穿孔，其穿孔部位一般比较小，可以采取腹腔镜手术或者开腹手术，修补穿孔位置。胃液、十二指肠液的腐蚀性比较大，十二指肠发生穿孔后，胃液、十二指肠液会进入腹腔，患者可能会出现相应的症状，就可以及时发现。一般来说，通过缝合修补穿孔位置，留置胃管，以及全身支持治疗等，肠穿孔是可以治愈的。

2、如果是小肠穿孔主要是由于克罗恩病、梅克尔憩室等导致的，且克罗恩病没有及时控制，就可能需要切除较大的肠段，但要尽可能保留部分小肠，减少短肠综合征发生的可能。

3、结肠穿孔和直肠穿孔一般是由于外伤、结肠憩室导致的。如果是结肠穿孔，可以手术切除穿孔位置，并吻合断端。如果是直肠穿孔，可以手术修补穿孔部位。一般来说，结肠穿孔和直肠穿孔还需要进行造口术，在术后3～6个月再进行造口还纳。如结肠镜检查导致结肠穿孔，进行修补后，还需要在近端做造口，保护吻合口，防止大便、细菌等影响吻合口的愈合。