输卵管囊肿是否严重主要取决于疾病的严重程度。

1、如果输卵管囊肿非常小，且患者没有明显的临床症状，就不太严重，可以先观察或者进行保守治疗，如药物治疗等。

2、如果输卵管囊肿比较大，且患者有相应的临床症状，就比较严重，需要进行手术治疗。

3、如果输卵管囊肿出现继发感染，且患者反复出现腹痛等，就非常严重，要及时进行治疗。如果不及时治疗，可能会发展为输卵管脓肿，甚至危及生命健康。