直肠黏膜内脱垂可通过保守治疗、手术治疗等方式治疗。
1、保守治疗：直肠黏膜内脱垂属于直肠脱垂的一部分，通常为部分或不完全性脱垂，可出现排便费力、排便不尽感等表现。一般先采取内科保守治疗，比如给予缓泻剂，常用如乳果糖、聚乙二醇等；还可遵医嘱适当服用具有润肠通便作用的中药，比如番泻叶等，以保持大便通畅。部分患者可能因直肠黏膜内脱垂，而出现局部潮湿、排便不尽感、异物感等局部表现，可采取高锰酸钾坐浴，或适当应用治疗痔疮的药物，以缓解局部症状。
2、手术治疗：如果患者经过内科保守治疗，不适症状并未缓解，甚至有加重趋势，可采取外科手术治疗。常用包括普通的外科切除、将脱垂黏膜切除再吻合等方式。目前临床上应用最多的是吻合器痔上黏膜环切术，属于一种微创手术方法。在手术时，医生会环形切除一圈直肠黏膜，然后使用吻合钉，进行黏膜及黏膜下组织的吻合，该方法具有疼痛轻、恢复快等优点。
