肠系膜上动脉栓塞的发病病情比较隐匿，其能否治好，即预后效果与发现的早晚、治疗的及时性有关。
1、如果能早发现，早治疗，则一般能治好。一旦出现疑似急腹症的早期表现，即症状与体征不相符（腹部压痛、反跳痛、肌紧张、板状腹等体征出现较晚，但是早期恶心、呕吐、全身发热等全身炎症反应较严重）时，患者应该及时就医。通常情况下，在发病早期，医生通过对肠系膜上动脉进行血管造影，可以及时发现栓塞部位，并且尽早对患者进行相应的治疗。部分患者在进行正规、及时的治疗后，身体可以得到康复，甚至患者的肠管可以得到保护，不至于造成严重损伤。
2、如果不能及时发现和治疗，则可造成病情进展，导致预后相对差。部分患者容易将该病的症状误认为成急性肠胃炎或者偶尔的腹痛，或者由于受其他疾病的干扰，比如糖尿病患者对疼痛不敏感，从而导致患者就诊不及时，使得医生没有及时发现患者的真正病因，最终导致患者错过最佳治疗时间。如果延误时间过久，患者可能会出现广泛性肠坏死，使得肠道菌群移位，进而造成腹腔感染，并且通过血液循环造成全身炎症反应，进一步导致周围循环衰竭和感染性休克，严重者可以导致多器官衰竭，甚至是死亡。
因此，肠系膜上动脉栓塞的进展情况与动脉堵塞程度、堵塞血管的分支大小以及就诊时间密切相关。总体来说，早发现、早治疗是提高该病治愈率的唯一方法。
