牙周袋是细菌引起炎症以后，破坏了牙周组织导致的。

牙周袋只是牙周炎的一种表现，菌斑、细菌是导致牙周炎发生的一种始动因素，但是最后能否发展成牙周炎也与宿主的反应密切相关。部分宿主对细菌非常易感，也有部分宿主感染细菌后，病情发展比较快，这些情况都更容易形成牙周袋。而牙周袋的形成是因为细菌引起炎症以后，导致牙槽骨、牙周膜等牙周组织发生破坏，进而使得结合上皮向根方移动，出现牙龈组织和根面的分离，通俗地讲，叫做“骨肉分离”，分离后就形成了牙周袋。

另外，如果牙龈比较薄，则牙龈会随着牙槽骨的退缩也退下去，称为牙龈退缩。牙龈退缩后，牙周袋不会太深，但是牙龈退缩后会导致牙齿变长、牙根外露。