由于导致种植体周围炎的原因主要为菌斑和牙石，所以种植体周围炎的治疗方法与传统的牙周炎类似，主要有龈上洁治术、龈下刮治术等。但是，一般不用传统的金属器械，直接对种植体进行治疗，因为一旦种植体表面出现划痕，可能导致菌斑更大量的堆积。

临床上，医生一般会选择比较特殊的洁治器和刮治器，如碳纤维、塑料的刮治器，但塑料的刮治器比较软，强度不够，一般很少选择。目前，比较常用的是钛金属制作的刮治器。此外，医生在进行龈上洁治时，会选择适用于种植体表面的超声工作尖。

除了以上的基础治疗，如果患者存在骨破坏的情况，还要进行手术治疗；如果种植体植入的位置不符合要求，应该将种植体完全取出，并在一段时间后，重新植入正确的位置。需要强调的一点是，患者一定要选择正规的医院，接受正规的治疗，否则，一旦种植体植入的位置不合适，就会留下很大的隐患，而医生在处理这些隐患时，可能有较大的难度。