灌肠是否会疼，需视具体情况而定。

1、一般情况下，在做肠道准备手术前，灌肠没有疼痛感。

2、部分患者在灌肠时，会感觉明显疼痛，可能因灌肠的导管刺破直肠；或者患者有肛门直肠疾病，比如肛裂、血栓性外痔、肛周脓肿等，当受到肛门导管的刺激后，可能产生剧烈疼痛。

3、如果患者无肛门疾病，在灌肠以后，腹部出现轻微隐痛，伴有排便感，多属于正常的现象，疼痛可能由于灌肠液刺激直肠，引起肠蠕动所致。一般在灌肠液与粪便排出体外以后，疼痛感可消失。