新生儿呛奶的原因主要有以下六个方面：

1、呼吸系统疾病，如气管食管瘘，即气管和食管之间存在一相通的管道，在经口喂养时，奶汁经过瘘管进入气管，就会出现呛奶。

2、喉部疾病，如先天性会厌过小或者会厌囊肿，会厌不能完全覆盖住气管入口处，也会导致新生儿出现呛奶。

3、消化系统疾病，如胃食管反流病等，由胃返流至食道的食物被吸入呼吸道，进而引起呛奶。

4、神经肌肉疾病，如先天性肌张力低下，肌肉软弱松弛，就会导致吞咽时会厌不能及时闭合，进而导致奶汁进入呼吸道，出现呛奶。

5、新生儿缺乏维生素A时，就会引起会厌上皮细胞萎缩角化，导致吞咽时会厌不能充分覆盖气道入口，出现呛奶。

6、在家庭护理中，喂养时机不当、喂奶速度过快、喂养时体位不合适等，都可能会诱发呛奶。