可以通过避免诱因、调整饮食、合理用药、心理护理等方面，预防功能性消化不良。
1、避免诱因：是最主要的预防功能性消化不良的方法，具体的措施包括避免幽门螺杆菌感染、避免胃酸过多等。
2、调整饮食：比如患者应该尽量避免吃刺激性、高脂的食物，也要尽量避免饮用高度白酒，以尽可能的避免功能性消化不良的发生。
3、合理用药：部分药物可能诱发功能性消化不良，尤其是老年患者所服用的降压药、降脂药、抗血小板药物，可能会使患者的胃肠道黏膜出现炎症，从而导致功能性消化不良的发生。因此，一旦患者的胃肠道存在不适，则在服药时，应该对相关药物进行调整，或者在医生的指导下，配合服用保护胃黏膜的药物。
4、心理护理：根据相关研究和治疗进展，更强调功能性消化不良属于一种肠-脑互动异常，也就是更强调中枢在疾病的发生、治疗中的作用。因此，患者应该避免精神方面受到刺激，调整生活方式，以缓解生活压力，并进一步调整处理事情的应对方式，以避免出现过度紧张、焦虑的不良心理。必要时，患者应该进行精神调节方面的治疗，包括药物治疗、心理治疗等，以预防功能性消化不良的发生。
