一般来说，虽然左归丸副作用不大，但是也不适宜长期服用。
具体来说，如果服药时间在1～3个月，一般问题不大；但是如果服药时间长达1～2年，一般就不太适宜。原因在于，左归丸有滋腻碍胃的特点，会影响消化功能。长期大量应用本药时，可能会影响患者的胃肠功能，引起食欲不振、腹胀、消化不良等。所以，在应用左归丸治疗肾阴虚一段时间后，如果患者症状有所改善，而且已经达到了预想的治疗效果，则应慢慢减少用药量，或者停药不再继续应用。
需注意，如果患者用药两周后，症状没有改善，或者症状反而加重了，则可能是辨证不对或不适用，或者患者虽然存在肾阴虚，但还合并其他因素存在，导致单用左归丸并不合适。此时，患者应及时停药并到医院寻求医生帮助，以免影响治疗，耽误病情。
