直肠溃疡的治疗，通常需要首先明确诊断，然后根据病因进行长期、规律的治疗。

1、如果是细菌感染引起的直肠溃疡，可遵医嘱应用抗生素治疗，同时局部应用一些药物，如栓剂或者坐浴等，有助于修复溃疡面，促进溃疡愈合。

2、如果是溃疡性直肠炎（一种炎症性肠病）引起，通常需在专业消化内科医生的指导下进行规律、系统的治疗，治疗方法较多，包括药物治疗等，如遵医嘱应用柳氮磺胺吡啶制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂以及中药等进行治疗。

建议直肠溃疡患者及时就医，在专业医生指导下，选择合适的方法进行治疗，以获得较好治疗效果。