颌骨囊肿可能会癌变，但是临床上较为少见。

颌骨囊肿是一个高发性的颌骨病变，若颌骨囊肿反复的进行手术，反复的出现感染，是可能出现癌变的。另外，如果颌骨囊肿术后出现复发，但复发后未及时治疗，经过一段时间也是可能发生癌变的。

需要注意的是，颌骨囊肿不仅可以发生癌变，还可以变成良性肿瘤，即成釉细胞瘤。但临床上患者就诊时，或者看到的是囊肿，或者看到的成釉细胞瘤，或者直接看到的就是颌骨癌，而不管发现的是哪种类型，都是需要及时治疗，不能任由病变发展。因此，从理论上讲，颌骨囊肿可以发生癌变，但无法明确其发生的全过程。