目前并没有明确的手段可以预防颌骨囊肿，但可以通过早期治疗防止囊肿继续长大，以及术后复查明确是否复发。

颌骨囊肿通常是在正畸治疗、镶牙、补牙或者拔牙过程中，进行口腔X线检查时发现的。当发现颌骨囊肿时，可以通过及时治疗，来避免囊肿的继续增大，造成继发感染，从而引起很多不必要的并发症。

另外，当颌骨囊肿进行手术治疗后，患者在术后两年内需要定期到医院复查，以明确是否复发。而由于颌骨囊肿是一个生长极其缓慢的疾病，因此，复查周期可以适当延长，通常在术后三个月复查口腔X线片，以检验是否有残留，之后间隔一年进行复查。

患者要保留复查结果，以便将结果进行对比。如果发现大部分颌骨的结构恢复，且颌骨原来的手术病变阴影没有变大，则颌骨囊肿没有复发；如果出现相反情况，或者在手术区域周围又出现了新的囊性病变，则考虑囊肿复发。