腋下毛囊堵塞，应该根据具体情况，选择合适的方法进行疏通。
1、如果只是单纯的腋下毛囊堵塞，没有明显的临床症状，平时应注意个人卫生，勤洗澡，洗澡时注意清理腋下区域，饮食要以清淡为主，避免食用高脂、油腻及辛辣刺激性食物，减少局部汗渍及油脂分泌，可能会达到疏通堵塞毛囊的效果，从而降低腋下毛囊堵塞发生的几率。
2、如果由于腋下毛囊堵塞而导致毛囊炎，患者应该及时到医院皮肤科就诊，在医生指导下服用抗生素（如头孢呋辛、头孢氨苄、多西环素等）或者抗真菌药物（如伊曲康唑、氟康唑、特比萘芬等），同时外用抗菌洗剂（如葡萄糖酸氯己定溶液、碘伏溶液、聚维酮碘溶液等）及抗生素药膏（如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏、克林霉素凝胶等），必要时还可以使用远红外线照射辅助治疗，促进炎症消退。若毛囊堵塞严重导致化脓，患者还可以通过手术方法切开引流。