慢性食管炎患者应在医生的指导下，服用H2受体拮抗剂、促进胃动力药物、制酸剂、质子泵抑制剂以及维生素类药物等进行治疗，以取得较好的效果。
1、H2受体拮抗剂。例如西咪替丁、盐酸雷尼替丁等，可以抑制胃酸分泌，降低反流物的刺激性，缓解反酸、疼痛等不适症状。
2、促进胃动力药物。例如甲氧氯普胺（胃复安）、多潘立酮等，可以增加食管下段括约肌的压力，促进食物的消化吸收及排空，减少胃内容物反流。
3、制酸剂。例如氢氧化铝凝胶等，可以中和胃酸，从而降低胃蛋白酶的活性，减少酸性胃内容物对食管制膜的损伤。
4、质子泵抑制剂。例如奥美拉唑等，可以阻断壁细胞的H+-K+-ATP酶，高度抑制胃酸分泌，改善不适症状。
5、维生素类药物。例如维生素A、维生素B2等，有助于保护胃肠道黏膜。
需注意，由于慢性食管炎的发生与不正确的饮食习惯密切相关，所以患者宜少食多餐，不宜过饱；尽量戒烟限酒，避免咖啡、巧克力、酸食和过多脂肪的摄入；睡前最好不要进食，晚餐与睡觉间隔时间应超过3个小时；且餐后应处于直立位或散散步，但要避免剧烈运动。