显微根尖手术的适应证主要有以下五个方面：

1、如果非手术根管治疗的效果比较差，无法再次进行治疗或者再次治疗后仍失败，就需要进行显微根尖手术。

2、如果根管钙化不通，且根尖周存在病变，就可以进行显微根尖手术，去除感染。

3、如果牙根存在解剖结构异常，牙根变异、根管严重弯曲等，会对根管治疗造成一定的影响，就可以进行显微根尖手术，控制感染。

4、如果是已经进行桩核冠修复的患牙，再次治疗时需要取出桩核固位体，但由于患牙可能会存在根折，就需要进行显微根尖手术。

5、如果是根尖囊肿，就需要进行显微根尖手术，去除根尖周围囊肿。