黏液表皮样癌的病因及发病机制目前并不明确。但是该病并不是单一的因素导致的，而是多种因素综合作用的结果。主要包括内在因素和外在因素。

1、内在因素：包括机体的免疫状态、基因突变以及自我的精神、心理作用等。

2、外在因素：包括环境因素、物理因素、化学因素等。

在多种因素的共同作用下，就可能会导致肿瘤的发生，尤其是恶性肿瘤的发生。但是，对于细胞恶变的具体机制，尚在研究之中。