新生儿脓毒症主要是由于细菌感染导致的，其治疗方法主要包括抗菌治疗和支持治疗。

1、抗菌治疗。如果怀疑新生儿患有脓毒症，先要积极进行血培养，再根据患儿的临床表现、前驱感染史、可能感染部位、常见致病菌等，经验性选择有效，且不良反应相对较小的抗菌药物进行治疗。在取得血培养和药物敏感试验结果后，要适当调整抗菌药物。

2、支持治疗。如果新生儿的临床表现比较差，如纳奶差、呕吐等，要合理提供营养和能量，保证水、电解质平衡。如果存在酸碱紊乱，要及时纠正，维持内环境稳定。