新生儿肺动脉高压是不能自愈的。

引起新生儿肺动脉高压的原因比较多，不论是肺血管发育不良等原发性病因所导致的肺动脉高压，还是窒息、膈疝、肺炎等引起的继发性肺动脉高压，都是不能自愈的，都需要在医师的规范指导下进行系统评估，并进行药物治疗和呼吸支持治疗，才可能会逐渐痊愈。

新生儿肺动脉高压是指生后肺循环压力和血管阻力持续性升高，使由胎儿型循环过渡到正常成人型循环发生障碍，以至于在动脉导管水平和（或）卵圆孔水平出现右向左分流。虽然新生儿肺动脉高压的病情一般比较严重，病死率也比较高，但大部分患儿的治疗效果还是比较好的。