肥儿疳积颗粒具有健脾和胃，平肝杀虫的功效。用于治疗脾弱肝滞导致的面黄肌瘦，消化不良。从本品的药物组成来看，本品不宜和以下药物合用：
1、本品含有牵牛子，不宜和巴豆或含有巴豆的中药制剂合用，如小儿七珍丸。根据中药“十九畏”可知，以上药物合用为配伍禁忌，会降低药物疗效。
2、本品含有甘草，不宜与海藻、大戟、甘遂、芫花合用，也不宜与含有海藻、大戟、甘遂、芫花的中药制剂合用，如内消瘰疬丸（含海藻），祛痰止咳颗粒（含甘遂、芫花），舟车丸（含大戟、甘遂、芫花）。本品与以上药物合用，属于中药“十八反”的配伍禁忌（藻戟遂芫俱战草），会发生毒性反应或副作用。
3、本品含有苦楝皮、槟榔、牵牛子，三者均有毒性。患者切不可为追求疗效，盲目合用含苦楝皮、槟榔、牵牛子的中药制剂，如健儿疳积散（含苦楝皮），芦连消疳丸（含槟榔），金玉丸（含牵牛子），以免毒性药物服用剂量过大，增加药物中毒风险。