引导组织再生手术，是在牙周翻瓣手术的基础上完成的一项手术，其手术过程如下：
首先需切开牙龈，并将牙龈翻开，暴露牙槽骨表面，然后清除牙槽骨内的大量肉芽组织，露出骨缺损，从而明确是否符合引导组织再生术的适应证。如果符合则可将人工生物膜覆于牙槽骨上，以阻挡牙龈的上皮细胞、结缔组织细胞等向根面生长，同时还可为牙周膜和牙槽骨的再生，创造一定空间。最后再将牙龈严密缝合。
另外，部分引导组织再生术需要与植骨术结合进行，即通过切口将牙龈翻开，暴露牙槽骨表面，清除牙根周围的肉芽组织、菌斑、牙石等刺激物，平整根面，并在骨缺损处放入人工骨，然后在人工骨上覆盖人工生物膜，最后将牙龈瓣复位并进行严密缝合。
