药物相关性骨髓炎的治疗，主要与疾病的阶段有关。

1、若疾病处于高风险期，即使用了可能导致骨髓炎的相关药物，但并没有变成骨髓炎，此类患者主要是加强医学教育，让其充分认识到自己的骨状态以及一旦发生骨髓炎可能带来的危害、伤痛，使患者做好充分的预防和心理准备。

2、若疾病处于零期，即患者使用相关药物后，没有出现牙疼、骨肿胀、嘴唇麻木以及瘘管等症状，但是在影像学上出现了改变，即相应的骨头已经出现了高密度的反应性增生或者低密度的破坏性吸收。此时主要是保持口腔卫生，并进行适当的抗炎治疗，使骨髓炎的发展变得缓慢。

3、若疾病处于一期，即患者牙槽突的区域内出现了实质性的病理性改变，并且可以探到瘘管，出现了牙齿松动甚至骨头的微小暴露，但患者此时症状较轻，没有剧烈的疼痛和化脓。此时主要是进行局部的定期冲洗以及使用抗生素以预防疾病进一步发展。临床上也主张实施早期的干预性治疗，即将骨髓炎的外科手术治疗提前，以期望通过手术干预使骨髓炎及时终止不再继续发展。

4、若疾病处于二期，即下颌骨的骨髓炎的病变已经破坏到了神经管水平以上，或者是上颌骨的骨髓炎已经接近上颌窦，但是还没有侵及上颌窦。此时需要进行手术清创治疗，通常将病变的骨骼去除之后，患处依旧可以保持完好的骨连续性，可以保持完好的骨外形，以及有充足的健康软组织进行缝合，预后比较好。

5、若疾病处于三期，即患者已经产生了瘘管、剧烈的疼痛以及大量的溢脓，并且完善口腔颌面部CT发现病变已经破坏到下颌或者已经侵及上颌窦以内了。此时需要进行区段性、方块性、节段性的骨切除，但是一旦切除后，颌骨就失去了骨的连续性，既不能支撑外形，也不能行使功能，对于此类患者在临床上主张在修复的同时进行适当的重建治疗。