小儿肛瘘的患者需要进行体格检查、影像学检查和其他辅助检查，明确肛瘘内口的位置，从而确定治疗方案。

1、体格检查。小儿肛瘘的临床体征相对比较典型，因此体格检查对诊断肛瘘比较重要。在检查过程中，患儿需取左侧卧位、截石位或者膝胸卧位，医生用手分开患儿肛门后，可发现肛门周围有肉芽样或者火山口样隆起，挤压隆起部位可有脓性分泌物溢出，且可触及条索样瘘管。另外，如果炎症反复刺激肛周皮肤，就可能会出现皮疹。

2、影像学检查。患儿还需要进行肛周B超或者彩超检查，观察瘘管走向，判断其是单纯性肛瘘还是复杂性肛瘘，并了解肛瘘和括约肌的关系。患儿也可以进行核磁共振检查，但由于患儿配合度比较差，可能会使检查难度增加。

3、其他辅助检查。患儿还可以进行瘘管注液检查，即将少量美蓝溶液或者双氧水从肛瘘外口注入，进而明确肛瘘内口的位置。其次，探针检查也可以明确肛瘘内口的位置。