新生儿化脓性脑膜炎的治疗时间是由多种因素共同决定的，如患儿的临床表现、机体状况、病原菌类型、有无并发症，以及脑脊液变化、常规生化指标等。

1、如果是存在免疫缺陷的早产儿，治疗时间相对会比较长。

2、如果是由于革兰氏阴性菌感染所导致的，至少需要使用抗菌药物治疗三周。

3、如果是由于革兰氏阳性菌感染所导致的，需要使用抗菌药物治疗两周。

4、如果脑脊液指标呈阴性，但患儿存在发热的情况，要注意判断有无并发症，如脑室膜炎等。如果存在并发症，治疗时间就会有所延长。