如果新生儿肠炎反复发作，要积极寻找病因，采取相应的措施。

1、病毒的传染性比较强，如果肠炎是由于病毒感染导致的，在治疗期间要做好隔离，避免二次感染。

2、如果肠炎是由于细菌感染导致的，长期使用抗菌药物可能会继发抗菌素相关性腹泻，就需要停止或者调整抗菌药物，并加服微生态制剂。

3、对于迁延性慢性腹泻的患儿，一定要进行彻底治疗，防止肠炎反复出现。

4、部分患儿存在免疫缺陷，容易反复出现消化道感染，就需要进行免疫指标检测，评估患儿的免疫状态。必要时还需要完善相关基因筛查，明确病因，积极进行对症支持治疗。