卵圆孔是胎儿在发育过程中，左右心房之间形成的微小通道。来自下腔静脉的氧气和血液大部分经卵圆孔进入左心房，再由左心室泵入全身。新生儿卵圆孔未闭合的危害主要取决于具体时期。

1、新生儿期的活动量比较小，且左右心房间血液分流量也比较小，因此新生儿期卵圆孔未闭的危害一般不明显。

2、如果到成人期时，卵圆孔仍未闭合，在各种原因情况下如剧烈运动、咳嗽、潜水等，就会导致右心房压力增高。当右心房压力高于左心房时，就可能会导致心脏内的血液出现明显的右向左分流，患者可能会出现脑卒中、偏头疼、减压病等。其次，卵圆孔未闭合相关的高凝状态，可能会诱发静脉栓子形成，增加反常栓子出现的可能性。