在正常情况下，胎儿在宫内可以吞入少量羊水，且不会刺激胎儿的胃黏膜。但如果在分娩过程中，胎儿吞入羊水过多，或者吞入被胎粪污染的羊水，或者吞入含较多母血的羊水，刺激新生儿的胃黏膜，导致胃酸及黏液分泌亢，从而引起呕吐。新生儿咽下综合征一般多见于有难产史、窒息史，以及过期产史的新生儿。

如果新生儿的症状比较轻，一般不需要进行进行治疗，通常在1～2天后，将咽下的异物吐净后，呕吐就会自然停止。如果新生儿呕吐比较严重，可以将新生儿置于侧卧位，使用温热的生理盐水洗胃，一般1～2次后，呕吐就会停止。必要时要暂停喂养，并静脉补充液体，提供营养，维持水、电解质、酸碱平衡。