卵泡囊肿和黄体囊肿，在发生时间以及超声表现上存在着明显区别。

1、发生时间不同。卵泡囊肿一般发生于排卵前；而黄体囊肿一般发生于黄体期。

2、超声表现不同。卵泡囊肿在超声下，多表现为边界清晰的无回声囊区；而黄体囊肿在超声下，囊腔内并不是完全无回声，除此之外，其还有可能表现为网格状的回声，这主要是由于囊腔内存在血液成分而导致的。

虽然卵泡囊肿和黄体囊肿存在上述诸多不同，但是，从本质上讲，二者均属于生理性囊肿的范畴。