牙源性角化囊肿的手术方式有很多种，如刮治术、开窗术、颌骨切除术等，而具体选择哪种手术方式，需根据角化囊肿的大小来进行判断。

1、刮治术。对于一些小型的牙源性角化囊肿，进行简单的刮治术治疗即可。刮治术就是从口腔内，通过手术直接将囊壁彻底刮除。由于刮治术手术范围比较小，因此颌骨的连续性依然可以保留，对患者的口腔功能影响也较小。

2、开窗术。对于一些特别大的，甚至可能几乎占据整个颌骨的牙源性角化囊肿，一旦做彻底的刮治术，容易将颌骨刮断，进而造成病理性的骨折。因此，对于此类患者，可以选择相对保守的开窗术进行治疗。开窗术是在大的角化囊肿上开一个窗户（即破口）且进行长时间的维持，以使囊肿中的内容物流出，当囊肿内压力和大气压相同时，颌骨内可以形成部分新的骨头。同时，当囊肿逐步缩小后，可以进行刮治术治疗，此时颌骨的完整性也可以保全。

3、颌骨切除术。其主要是用于多次复发牙源性角化囊肿的患者。此类患者在经历过刮治术或者开窗术的治疗后，已经不能再通过这两种手术获得较好的疗效，需要进行颌骨切除术治疗。在切除颌骨后，会遗留有相应的颌骨缺损。但随着医疗技术的发展，目前通过从全身的其他部位取骨，可以移植到缺损的下颌骨部位，进而实现功能性和美观性的治疗效果。