用棉签掏耳朵不好，具体原因如下：
1、用棉签掏耳朵可能会导致真菌性外耳道炎发生。掏耳朵应使用无菌棉签，但如果棉签被长期放置于潮湿、阴暗的环境中（如浴室内等），可能会滋生真菌，而一旦用这种棉签掏耳朵，真菌可能会进入耳内，引起外耳道炎症。
2、长期用棉签掏耳朵可能会导致耵聍栓塞等病变。用棉签掏耳朵时，可能会将耳内的耵聍推向耳道深处，甚至推至鼓膜表面。长此以往，由于耳内耵聍堆积，可能会导致耵聍栓塞，影响听力；此外，如果由于游泳等原因导致耳内进水，堆积的耵聍吸水膨胀，也可能会引起听力下降，甚至导致外耳道炎、外耳道假性胆脂瘤等病变。
3、用棉签掏耳朵可能会导致耳内损伤。如果用棉签掏耳朵时过于用力，或者掏耳时被人意外碰撞使棉签进入耳道深处，可能会导致鼓膜穿孔等情况发生。