扎冲十三味丸为处方药，患者一定要在医生的指导下才可以服用本品。因为每个患者的体质、病情以及对药物耐受程度都不相同，所以医生给每个患者的用药方案也不尽相同。患者具体一次吃几粒，一日吃几次，需要吃几个疗程，都应听医生的，切忌自行调整用药方案或者盲目使用他人的用药方案。
本品为口服的丸剂，患者应该用温开水吞服本品。因本品有镇静安神作用，建议患者在晚间临睡前服用本品，或按医嘱服用。
本品所含的制草乌有毒，患者应严格按照医生指导的用量服用，不得自行增加服用量和服药时间。本品过量服用可能会出现唇舌发麻、头痛头晕、腹痛腹泻、心烦欲呕、呼吸困难等症状，如出现上述症状或出现其他任何严重、持续或进展性的症状，应立即停药并及时就医。