阴式彩超和腹式彩超本质上都是超声检查，只是探头的入路不一样而已，两者各有优点和劣势。
腹部彩超是从腹部进行观察，可能会隔着比较厚的脂肪层。而阴式彩超是用特殊的阴道探头从阴道进入，对宫颈进行观察，所以并不太受脂肪厚度的影响，该检查与子宫宫腔距离更近，看得会更清楚。
一般太过肥胖的女性不建议进行经腹部超声检查，最好采用经阴道超声检查；对于可疑子宫内膜病变的女性建议尽量采用经阴道超声检查。
但是，对于阴道萎缩比较严重的老年女性以及无性生活的女性，则不建议做经阴道超声；对于早孕和晚孕期孕妇容易流产或者诱发早产的情况下，也不建议做经阴道超声。