女性沙眼衣原体阳性是否严重，需根据是否出现了严重后遗症而定。

1、如果女性沙眼衣原体感染，得到了及时且正规的治疗，并且没有出现严重的后遗症时，则表明此种情况并不严重。

2、如果女性沙眼衣原体感染，没有得到及时且正规的治疗，就可能会出现炎症疾病的后遗症，比如部分患者会由于输卵管不通而出现不孕；部分患者会出现严重粘连；还有部分患者会迁延形成慢性炎症，导致出现慢性盆腔疼痛。在临床上，不孕或者慢性盆腔痛，都是女性较难治愈的疾病，所以此种情况较为严重，希望能够引起患者的高度注视。