女性沙眼衣原体感染，一般是不会自愈的，建议患者及时进行相应治疗。

在临床上，沙眼衣原体感染可能会导致女性出现宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎，甚至是整个的盆腔炎症，而且如果沙眼衣原体感染得不到及时且正规的治疗，还可能会导致输卵管不通，从而造成女性出现不孕等严重危害。

所以，建议患者及时前往正规医院就诊，并在专业医生的指导下，进行针对的抗生素治疗，比如四环素类抗生素、大环内酯类抗生素、喹诺酮类抗生素等，其中阿奇霉素、红霉素类口服抗生素等大环内酯类抗生素的应用较为普遍。另外，在日常生活中，患者还需增强自身抵抗力，可在一定程度上帮助疾病痊愈。