根尖肉芽肿不可以自愈。

仅依靠机体自身的免疫系统，根尖肉芽肿的病变是无法自行愈合的。这是因为根管内的牙髓组织发生坏死时，根管内的血供也就没有了，而机体的免疫系统无法在没有血供的区域发挥作用，所以根管内的感染物质无法通过免疫系统进行清除。而根管内的病原微生物会持续刺激根尖周组织，就可能会导致根尖周围的炎症反复发作，迁延不愈。

所以根尖肉芽肿的患者，要及时进行人为干预，通过完善的根管治疗以及其他治疗措施，彻底清除感染源，从而促进病变组织愈合。