十二指肠憩室不能自愈。

十二指肠憩室本身是一种结构异常，表现为十二指肠部分肠壁向外凸出，形成袋状突起。其可能与肠壁先天发育异常有关，比如肌层发育不良，再加上腹腔内压力增加，就可能导致肠壁向外凸出。

如果是先天性的十二指肠憩室，各个组织层次都正常，且没有明显症状，则一般不需要特殊处理；如果出现了炎症、出血、疼痛等症状，则需要对症进行内科保守治疗；极个别的十二指肠憩室，如果出现了梗阻、癌症等，则需要进行外科手术治疗。

需注意，十二指肠憩室通过内科保守治疗，只能缓解症状，无法让憩室彻底消失。所以，十二指肠憩室不能自愈。