肠系膜囊肿，一般来说是良性病变，但是如果不及时干预，其会逐渐增大，甚至会增大到很大的体积。所以肠系膜囊肿一旦确诊以后，应积极进行外科手术治疗。具体手术需要注意以下方面：

1、如果是孤立性的肠系膜囊肿，则可以通过腹腔镜或者开放手术来摘除。

2、如果肠系膜囊肿长在小肠的系膜根部，而且与血管关系非常密切，则有时会采取开窗引流手术，以免破坏系膜血管，进而造成肠道坏死。但需注意，采取开窗引流手术，应除外寄生虫感染引起的囊肿。

3、如果肠系膜囊肿的囊壁很完整，则可以进行小肠和囊肿的Rou-Y吻合术。

4、如果肠系膜囊肿累及到了小肠，则小肠血管可能会发生破坏，此时可能会先将囊肿和坏死的小肠一起切除，之后再进行肠道吻合手术。