牙内吸收多见于受过外伤的牙齿、再植牙或者经过牙体预备的牙齿，但其病因尚不明确，目前认为可能是由于牙髓组织受损后，出现炎症细胞浸润，导致牙髓组织发生肉芽性变，分化出破牙本质细胞，并与牙体硬组织的特殊成分结合所引起的。

在正常情况下，成熟的牙体硬组织表面始终会覆盖一层没有矿化的、不成熟的前期牙本质，该结构可以起到保护作用，从而防止牙内吸收的发生。但在病理状态下，这部分保护性结构缺失，就可能会成为牙内吸收发生的始发点。