如果已经明确患者的精神障碍是由躯体疾病而导致的，在治疗时则应积极治疗其原发病，并且应注意选择对精神活动影响较小的药物。

1、积极治疗原发病。例如，如果由于身患肺炎，出现高热，导致患者出现谵妄，则应积极进行抗炎治疗。一般来说，当患者的炎症被控制，体温恢复正常，其大脑功能也会逐渐恢复，患者可以获得较为彻底的治疗效果。

2、注意选择对精神活动影响较小的药物。例如，部分癫痫患者会出现精神活动异常，而在抗癫痫药物中，存在可以稳定精神活动的药物，也存在可能会造成焦虑、精神病性症状、睡眠障碍的药物，因此，医生在选择药物治疗其原发病时，应尽量选用对精神活动影响较小或具有稳定作用的药物，患者才能获得更好的治疗效果。

需要注意的是，在治疗过程中，应密切关注患者躯体疾病的走向，以帮助判断是否存在其他影响因素导致的精神心理障碍，防止漏诊。