唇裂主要是由于遗传因素、环境因素造成的。
1、遗传因素约占25%，比如染色体异常、基因突变等。目前已经明确的相关基因有50多个，分布在22条不同的染色体上，其既可以是遗传于父母，也可以是散发出现。
2、环境因素约占10%，比如母体服药史（如维甲酸、巴比妥类药物、叶酸拮抗剂、卡马西平、抗焦虑药物、镇静药物、激素等）、母体基础疾病（如妊娠性糖尿病、流感、疱疹性病毒等）、母体不良嗜好（如吸烟、酗酒、肥胖、压力过大等）、母体营养状况（如叶酸缺乏、维生素A过量服用等）、外源性暴露因素（如氯仿、颜料、色素、装修物、杀虫剂等）。
需要注意的是，环境因素和遗传因素可以相互作用，产生叠加效应，此类因素约占唇裂发病因素的65%。
