小儿奇应丸由雄黄、朱砂、天竺黄等十几味药物组成。从本品的药物组成来看，本品不能与以下药物合用：
1、本品含雄黄，不能与硫酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐及亚铁盐类西药（如硫酸锌、硝酸异山梨酯片、速力菲等）合用，因雄黄所含硫化砷可与无机盐反应生成硫化砷酸盐沉淀，既阻止西药的吸收，又使含雄黄失去原有的疗效，并有导致砷中毒的可能。
2、本品含朱砂，与碘化物、溴化物（如碘化钾、溴化钙等）同用，可在肠道内生成碘化汞或溴化汞，毒性增强，并能导致药物性肠炎，所以不宜合用。
3、本品和其他药物合用，也可能发生药物相互作用，降低药物疗效或增加毒副作用。因此，为确保安全用药，患儿用药期间如需合用任何其他药物，请家长务必先咨询医生，绝不可擅自合用。