任何外科手术都会存在一定的风险，所以唇腭裂二期修复也会有一定的风险，其风险主要有以下三个方面：

1、唇腭裂二期修复需要进行麻醉，患儿就可能会出现麻醉意外，或者由于呼吸道插管而出现水肿等不良反应。

2、唇裂二期修复可能会导致患儿外形恢复不佳，还可能会出现疤痕增生、术后伤口感染等风险。

3、腭瘘二期手术后，部分患儿可能会再次出现腭瘘。