小儿化食丸为处方药，患儿需要在医生的辨证指导下服用，具体的用药剂量、用药频次、用药疗程等问题都需要听医生的指导。由于每个人体质、病情等情况不同，所以每个人的用药方案会存在差异，请家长谨遵医嘱给孩子用药，切勿自行调整用药方案或模仿他人用药。
本品常见为大蜜丸，通常在饭前或饭后嚼服或分份吞服，但不可整粒吞服。患儿服用小儿化食丸时，家长应在一旁监护或者帮助给药，以免出现多服、少服、噎住等情况。本品消食导滞的作用较强，一般见效就应停药，不宜长期服用，以免影响正常的胃肠功能。
另外，饮食和生活上，需多喝水，注意休息，不吃辛辣、生冷、油腻的食物。平时家长应让孩子多吃一些泻火通便的水果，如香蕉、火龙果、猕猴桃、酸奶等，促进排便，并多带其参加户外运动或体育锻炼，增强胃肠蠕动，以减少胃热积食。