胆汁反流性胃炎最主要的病因是胆汁从十二指肠逆流进入胃腔。导致胆汁逆流的原因很多，具体如下：

1、手术因素。手术因素是较常见的因素。胃大部切除术后，胃和肠道进行了人为的吻合；十二指肠的内容物在术后经过胃进入远端的肠道，可以出现长时间的胆汁反流，发生较重的黏膜病变，如胃黏膜充血、淤血或其他病变等。

2、幽门括约肌功能障碍。幽门是一个肌肉性结构，它的收缩可以防止十二指肠内的物质反流入胃腔。当幽门括约肌的功能出现障碍，抗反流能力减弱时，也容易出现胆汁反流性胃炎。

3、十二指肠动力异常。十二指肠出现了逆蠕动，不是由近端向远端蠕动，而是由远端小肠向胃侧蠕动，将十二指肠内容物推入胃腔中，最终导致胆汁反流性胃炎。