医用漱口水和普通漱口水的区别，主要体现在成分、作用、用法用量以及购买渠道等方面。
1、成分不同：医用漱口水的成分包括聚维酮碘、氯己定、过氧化氢等；而普通漱口水的成分包括水、香精、表面活性剂、酒精、氟化物等。
2、作用不同：医用漱口水具有杀灭病原体、消除炎症的作用，主要用于口腔炎症的辅助治疗；而普通漱口水具有清洁口腔的作用，只能暂时减少口腔内的细菌，可以用作日常口腔健康的护理，但不能用于疾病的治疗。
3、用法用量不同：医用漱口水具有严格的用法用量，需要在医生指导下或按照说明书使用，而且不能长期使用，否则会抑制口腔内的细菌，造成口腔菌群失调；而普通漱口水对用法用量并没有严格的要求，可以长期使用。
4、购买渠道不同：医用漱口水属于处方制剂，只能在医院买到；而普通漱口水属于非处方制剂，在药店甚至超市就可以买到。
提醒患者的是，部分漱口水当中含有防腐剂，漱口后应吐出口外，避免咽下；而且，漱口后应保持口腔内的药物浓度至少20分钟，不要立即用清水漱口，也不要马上进食、进水；此外，两种漱口水不能一起使用，一般在使用一种漱口水后，需要间隔几个小时后再使用另一种漱口水，以免药物之间相互作用。
