对于灰指甲，如果使用局部外用药物治疗，则需要每天刮指甲；如果仅使用口服药物治疗，则不需要刮指甲。灰指甲是由皮肤癣菌感染所引起甲板浑浊、增厚、分离、变色、萎缩、表面凹凸不平等，目前主要是通过使用抗真菌药物治疗。
1、局部外用药物：对于较为浅表且受损甲板面积较小的患者，可先用小刀或指甲锉尽量刮除病甲表面，再外用冰醋酸溶液或碘酊，每天2次，直至新甲长出为止。如果外用阿莫罗芬搽剂等抗真菌药物，也可先用温水浸泡软化病甲，再刮除甲板上的碎屑，然后使用药物。这样做是为了让药物更好地渗透进入甲板，从而发挥药效。
2、口服药物：对于病变已累及甲母质者，外用药物难以渗透，需口服抗真菌药物治疗，如特比萘芬片、伊曲康唑胶囊等。口服药物的药物成分是通过血液达到病变部位的，一般不需要每天刮磨指甲。在临床实际中，为提高疗效，更多情况下会选择局部治疗和口服药物联合应用。
需要注意的是，由于药物不易进入甲板，且指甲生长缓慢，因此灰指甲的治疗需要长期坚持规律用药。在治疗期间，应同时治疗手足癣，并做好个人卫生，不与他人共用拖鞋、浴巾、寝具等私人物品，以防复发。