毛囊炎化脓后，一般不能自愈。
毛囊炎是局限于毛囊口的化脓性炎症，本病主要与细菌、真菌等病原体感染有关，常见表现为毛囊周围的红色丘疹，可伴瘙痒、疼痛等。如果症状较重或未及时治疗，病变可累及毛囊深部及周围组织，甚至引起化脓，从而造成发热、寒战等全身症状，此时，疾病自愈的可能性不大，建议患者及时去正规医院皮肤科诊治。
医生会根据感染病原体的类型、病情严重程度，制定合适的治疗方案。对于病情较轻者，一般外用药物即可，常用药物如莫匹罗星软膏等抗生素类药物，酮康唑乳膏等抗真菌类药物，必要时，还可配合口服药物治疗；对于病情较重者，可进行切开引流，以排出脓液。
总之，毛囊炎化脓后，患者需及时治疗，不要寄希望于疾病自行好转，以免延误治疗，甚至造成败血症等严重后果。